Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ALS2CR12Q96Q35 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms