Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LMTK3Q96Q04 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LMTK3Q96Q04 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms