Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85AQ96PX6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms