Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP3Q96P20 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms