Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms