Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PHACTR3Q96KR7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHACTR3Q96KR7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms