Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS50Q96JG6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VPS50Q96JG6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms