Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COG3Q96JB2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms