Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CALML4Q96GE6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALML4Q96GE6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms