Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SYTL4Q96C24 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYTL4Q96C24 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms