Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC102AQ96A19 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms