Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFKQ969G6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms