Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXB13Q92826 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms