Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TAF4BQ92750 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4BQ92750 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms