Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALLDQ8WX93 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALLDQ8WX93 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms