Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTLL11Q8NHH1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTLL11Q8NHH1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms