Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf106Q8NAJ2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf106Q8NAJ2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms