Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms