Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLF2Q8IX21 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLF2Q8IX21 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms