Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms