Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMC4Q7Z404 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMC4Q7Z404 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms