Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9AQ7Z3C6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9AQ7Z3C6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms