Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STRCQ7RTU9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRCQ7RTU9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms