Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM5Q71RC9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms