Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
XIRP1Q702N8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
XIRP1Q702N8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP1Q702N8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms