Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms