Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BLOC1S2Q6QNY1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms