Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC27A1Q6PCB7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms