Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC42EP5Q6NZY7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms