Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGMBQ6NW40 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms