Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC144NLQ6NUI1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC144NLQ6NUI1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms