Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ECM29Q5VYK3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECM29Q5VYK3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms