Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD4Q5VX71 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms