Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDGFL1Q5TGJ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms