Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAD1Q5T700 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms