Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC183Q5T5S1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms