Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
FRMPD1Q5SYB0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRMPD1Q5SYB0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms