Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERC4Q5GLZ8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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