Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFT2D3Q587I9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms