Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms