Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBPF20Q3BBV1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBPF20Q3BBV1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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