Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF1Q3BBV0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NBPF1Q3BBV0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms