Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSPP1Q1MSJ5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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