Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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