Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SF1Q15637 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SF1Q15637 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SF1Q15637 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SF1Q15637 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SF1Q15637 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SF1Q15637 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SF1Q15637 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SF1Q15637 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SF1Q15637 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SF1Q15637 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SF1Q15637 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SF1Q15637 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SF1Q15637 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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