Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERV3-1Q14264 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms