Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX2Q13950 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RUNX2Q13950 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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