Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCINQ13939 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCINQ13939 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCINQ13939 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCINQ13939 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCINQ13939 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCINQ13939 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCINQ13939 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCINQ13939 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCINQ13939 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCINQ13939 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms