Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPTAN1Q13813 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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