Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATRQ13535 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATRQ13535 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATRQ13535 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATRQ13535 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATRQ13535 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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